המאגר הביומטרי אינו עומד בתקני האבטחה הנדרשים
כדי שהמערך הביומטרי יעמוד בדרישות האבטחה, נדרש אישור כפול – שתצורת המערכת מספקת את רמת האבטחה הנדרשת, ושהמערך עצמו נבדק ונמצא בטוח – לאחר עריכת סקר סיכונים ולאחר שעמד במבדקי חדירות מקצועיים. לדברי הרשות הביומטרית, נכון לפברואר 2014 בדיקות אלו טרם נערכו ו/או טרם הושלמו.